12博BET官方网站目前设有飞行器工程、飞行器控制、发射与推进工程和力学四个系，和深空探测技术、分布式航天系统技术、空间结构动力学与控制、无人飞行器自主控制四个研究所。
 

　　深空探测技术研究所：成立于2009年，主要研究包括深空探测目标选择与轨道设计、深空探测自主导航与制导控制、深空探测自主任务规划与执行、小天体伴飞附着的导航与控制、深空探测系统仿真与演示验证。
 

　　
　　分布式航天器系统技术研究所：成立于2010年，主要研究包括：复杂航天器动力学建模及隔震机理研究；灵敏航天器多约束姿态机动与控制技术研究；空间自主操作机构运动规划与控制技术研究；空间目标视觉测量与自主导航技术研究；空间目标主动捕获与在轨操控技术研究；
　　

空间结构动力学与控制研究所: 成立于2009年，主要研究各类大型柔性空间结构和高超音速飞行器结构，在复杂空间环境中的动力学与控制问题，研究包括刚-柔多体系统动力学、结构声振耦合动力学分析、大型空间结构振动与波动控制空间结构缩比样机地面展开实验等方向。

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　　无人飞行器自主控制研究所：成立于2014年，由12博BET官方网站与北京中航智科技有限公司联合成立。该研究所根据国家战略需求和北京市通用飞机发展计划，制定“优势互补、协同创新、技术引领、服务社会”的发展战略，研究方向包括无人飞行器自主控制技术、无人飞行平台体系协同控制技术等方向。